《宇宙星神》副本分为三个难度简单、普通、困难。
简单难度:一般的玩家均可以完成,是初期零件积累、星神升级的最佳场所,但是奖励也是最差的。
普通难度:需要一定的星神等级和零件才可以完成,是中期玩家升级打宝的合适地点。
困难难度:是高级星神、高级零件和高级技能星神打宝练级的挑战场所,当然奖励也最丰厚。
在解锁各个副本的过程中,怪物难度也呈递增状态,等级越高的副本难度越高。
注意:只有在完成简单后简单难度后才能进入普通难度,同样困难难度需要打通普通难度的关卡才可以进度。