混沌的睁开双眼，整个世界由模糊逐渐清晰……
主人翁晃动了一下麻木的身体，被疼痛刺醒，隐约看到两个黑袍红云纹饰的男人离去。身侧，是一个面带关切的陌生男性忍者，突然袭来一阵刺骨的疼痛，主人翁再次昏睡过去……而过往的记忆也随之消散。
没有人知道他的身世来历，甚至连主人翁自己也对自己的过去深感困惑。被木叶村暗部救下的他，身上似乎天生就有着成为优秀忍者的天赋和潜质，就这样适应了忍者世界的生活。
忍者之路遍布荆棘，主人翁曾被晓组织袭击并企图带走，这让每个主人翁身边的人都给予他更多的关怀。从以防身为目的传授他忍术，而主人翁天生的优秀潜质和勤奋，让他在很短的时间内实力便足够匹敌各路忍界精英。
成长的道路总是漫长并且坎坷的。此事的主人翁，已经不只是为了保护自己而活着了。他的生命有了更多的意义，保护同伴、保护村子，更担负着忍界和平的责任，奔走于忍界各大国之间。而主人翁，也一边为了【影】这个位置而努力着。一边，为了追寻恶势力组织而展开了生命的征途。
在这个忍者的世界里，忍者基本上是一个雇佣兵形式的角色：平时以接各种任务获取酬金为生，战时转为战斗部队。主人翁就这样生活在这个世界当中，他的出色逐渐被所有人认同，在一次次惊险的战斗中，他终于遇到了一直在寻找的晓组织。主人翁一直没有放弃寻找有关他身世信息的任何机会。
主人翁最终成为一名如神话传说般厉害的忍者。而此时，他还是没能了解到自己的身世来历…… 前方等待着他的又会是怎样流刃若火或高潮迭起的故事呢?
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