光有强大的舰队是远远不够的，要使自己的势力强大起来，必须有一个高品质的指挥官队伍，接下来我们将对《超时空舰队》的指挥官系统进行详细说明。
一、指挥官界面介绍
首先点击指令面板上的“军官”按钮，弹出指挥官信息面板。
指挥官列表
①在这里玩家可以查看到当前拥有指挥官的数量，可以任意选择指挥官进行详细查看。
指挥官信息
②我们将指挥官面板有6大信息，分别为指挥官品质、改名、等级、指挥舰、经验值，以及成长属性值，同时可以对指挥官进行复活及属性值重新分配操作(各自需要使用道具)，接下来进行逐一介绍。
1、指挥官品质：
指挥官品质是指挥官的综合素质体现，是独立于5项成长属性值的另外一个重要属性。
指挥官品质对探险生还率，指挥舰攻击力，和复活时间以及各方面性能都有着很大影响。
指挥官品质总共划分为5大类，分别用不同颜色来区分品质，各自需要相应的聘用合同书来招募。
依次按照以下顺序排列来表示
灰色→绿色→蓝色→紫色→橙色
其中前四种颜色都可以通过星盟交易所内的特殊道具类别里购买获得，其中橙色作为游戏中最高品质的指挥官聘用合同书，只能在星盟拍卖里不定时拍卖获得。
2、改名：在指挥官信息区内，玩家可以按照自己喜好，在指挥官名字的右侧点击“更名”按钮给指挥官更改名字。
3、等级：在游戏中统一用“LV”来表示指挥官等级，随着指挥官在各种操作中升级进行等级提升。
4、指挥舰：指挥舰是指挥官出行的必备之物，前期可以登陆自己的星球表面，在造船厂购买获得，指挥舰分布在银河世界的各个星球上，每个星球贩卖的指挥舰都不相同，如果不喜欢自己星球上的指挥舰欢，可以派出指挥官到其它星球逛逛，也许就会发现强大的座舰。
指挥舰可以在指挥官外出遭到敌人攻击时提供保护(消耗装甲)，也能在战争中提供攻防加成。
当指挥舰的装甲降为0时，指挥舰就会报废。
指挥官购买指挥舰时会提示替换信息，游戏中没有指挥舰放置的场所，所以购买指挥舰时候需要谨慎抉择。
5、经验值：指挥官可以通过多种途径提高等级，包括战争、野外探险、在军事学院学习等，都是获得经验值的好方式。
6、成长属性值：当指挥官升级之后会得到1-4点可分配的能力点数(指挥官品质影响升级获得的能力点)，点击你想提升的能力值后面的“+”号按钮，就可以提高这项属性了。
指挥官属性值说明：
指挥官的五项能力值影响着游戏中各方面的结果。
智慧：增加探险、偷窃、拾取太空垃圾所获得的奖励，以及提高“设施破坏”的破坏效果。
毅力：降低指挥官各种活动的体力消耗，增加野外探险的生还率。
统帅：增加战斗中编队的攻击力，增加指挥官的带兵上限，提高指挥舰的攻击力。
幸运：增加探险和战斗获得道具的概率。
魅力：在星际贸易进行中降低购买货物的价格，并且提高出售货物的价格。
二、飞行队列
③飞行队列是舰队战斗时的一种阵型，不同的队列可以提供不同的攻防加成。
新招募的指挥官都只拥有一种初级队列，要想学习更实用的队列，必须得到“飞行队列指南”。
飞行队列总共分为5种类型，各自在战斗中拥有不同的属性加成效果，其中标准队列作为指挥官初始队列，不拥有任何加成效果，分别为：标准队列、三角队列、突击队列、叉形队列、包围队列、自由队列
飞行队列指南可以在星盟交易所购买，或者通过其它途径获得，包括战斗获胜得到的战利品、野外探险的收获、任务系统、(小技巧：通过这些途径可以免费得到很多种星盟交易所出售的较为初级的道具)
同时在此处还可以查看已经学习的战斗战术，各种战术在战斗中拥有不同的战术效果战术分为3种类型，其中标准战术作为指挥官初始战术，不拥有任何加成效果。
分别为：标准战术、攻弱战术、攻克战术、攻近战术
三、指挥官状态信息
④我们通过此处可以查看指挥官当前位于星系坐标，以及所属空间站编制信息以及目前指挥官复活时间状态。
同时通过点击“所在星球”及“所在星系”按钮可以直接跳转到指挥官当前所在处，方便玩家随时对指挥官进行操作，特别是找不到指挥官在何处，又想立即操作的玩家，使用这个功能会很方便。
四、指挥官道具使用及解雇
⑤在这里玩家可以随时对指挥官进行道具使用以及指挥官解雇，其中大部分针对指挥官功能的道具都必须在此处进行使用操作。
五、指挥官招募
⑥此处为指挥官招募窗口，所有指挥官分为灰色→绿色→蓝色→紫色→橙色五个品质，橙色为最高级。
指挥官品级不同，所具备的能力值也会有很大的差别。招募列表每天会自动刷新一次，运气好的话，会出现高级指挥官等待你的招揽。
如果觉得当前列表的指挥官品质太低，则可以点击“召集”按钮进行即时刷新列表，不过前提是要有道具“指挥官召集令”才可以，在游戏初期的新手任务里，会免费赠送数量不等的召集令供玩家使用。
招募指挥官需要“指挥官聘用合同书”，在游戏初期的新手任务里，会免费赠送一个灰色指挥官合同书，让玩家能够招募到开国将领。而更高级的就只能在星盟交易所购买了。
指挥官聘用合同书一共分为五种，同样也是由颜色组成，对应指挥官品质颜色。
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